Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS8Q8N3P4 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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