Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTF1AQ7RTS3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTF1AQ7RTS3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms