Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXO38Q6PIJ6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms