Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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