Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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