Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DSC2Q02487 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms