Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPIBQ01892 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms