Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LMO4P61968 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms