Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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