Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT13P13646 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms