Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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