Protein–RNA interactions for Protein: O00488

ZNF593, Zinc finger protein 593, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF593O00488 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZNF593O00488 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms