Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGNQ9P2M7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms