Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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