Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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