Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms