Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC7AQ5VTJ3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms