Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FHL3Q13643 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms