Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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