Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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