Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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