Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP7AQ04656 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP7AQ04656 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP7AQ04656 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP7AQ04656 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP7AQ04656 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP7AQ04656 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP7AQ04656 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP7AQ04656 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP7AQ04656 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP7AQ04656 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms