Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DEFB1P60022 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms