Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms