Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAEP38570 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAEP38570 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAEP38570 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAEP38570 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAEP38570 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAEP38570 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAEP38570 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGAEP38570 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGAEP38570 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGAEP38570 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms