Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms