Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DENRO43583 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DENRO43583 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DENRO43583 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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