Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
XCL2Q9UBD3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms