Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN3Q9P232 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms