Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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