Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms