Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGAP1Q96PV0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms