Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CLIP4Q8N3C7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CLIP4Q8N3C7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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