Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MTA2-202ENST00000524902 2577 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RGL4-201ENST00000290691 2885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC022107.1-201ENST00000624833 3094 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ELF5-205ENST00000532417 2330 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CHMP2B-203ENST00000471660 2528 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ACSM2B-202ENST00000414188 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DLST-202ENST00000334220 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RAB7B-202ENST00000617991 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms