Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDRF1Q3B7T1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms