Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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