Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PTCH1Q13635 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PTCH1Q13635 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PTCH1Q13635 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PTCH1Q13635 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PTCH1Q13635 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PTCH1Q13635 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTCH1Q13635 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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