Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CUL3Q13618 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CUL3Q13618 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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