Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SRSF5Q13243 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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