Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NIPAL4Q0D2K0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NIPAL4Q0D2K0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NIPAL4Q0D2K0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms