Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2IP63279 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms