Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2BFSP57053 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms