Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NCKAP1LP55160 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms