Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms