Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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