Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E1P29083 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms