Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
IFITM1P13164 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms