Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GLI4P10075 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms