Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms