Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms